O sistema de classificação de Whittaker foi desenvolvido em 1969 e posteriormente modificado em 1979. A grande diferença entre estas duas versões refere-se à posição das algas. Inicialmente estavam distribuídas entre o Reino Protista e Plantae, consoante fossem, respectivamente, unicelulares ou pluricelulares, foram colocadas no Reino Protista, devido à sua simplicidade estrutural, apesar da pluricelularidade de muitas delas. O facto de o Reino Protista passar a incluir seres multicelulares de baixo grau de diferenciação celular leva alguns autores a sugerirem o nome de Protoctista para este reino.
O sistema de clasificação de Whittaker divide os seres vivos em cinco reinos, tendo sido usado os seguintes critérios de classificação:
- Nível de organização celular e estrutural
- Monera: seres procariontes
- Protista: seres eucariontes unicelulares
- Plantae, Fungi e Animalia: seres eucariontes multicelulares
- Tipo de nutrição
- Monera: seres fotossintéticos, quimiossintéticos e por absorção
- Protista: por absorção, ingestão ou fotossíntese
- Plantae: seres fotossintéticos
- Fungi: por absorção
- Animalia: por ingestão
- Interacções nos ecossistemas
- Produtores: seres autotróficos
- Macroconsumidores: seres heterotróficos que ingerem alimento
- Microconsumidores: seres heterotróficos que decompõem matéria orgânica e absorvem produtos.
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